在化学、材料和生物医药等领域,诸如乳液稳定性、三次采油及憎水材料等的界面张力研究中,分子动力学模拟已成为一种高效且精确的研究手段。而 GROMACS 作为一款高性能的开源 MD 模拟软件,是相关科学研究和工程应用中的重要工具。
本期最佳实践,我们将在超算互联网平台使用 GROMACS v2023.2 加速版,对油-水体系的界面张力进行计算,此次分子模拟工作流设计思路是搭建油相模型——平衡——拉长模拟盒子——加入水分子——平衡——固定盒子形状模拟——计算界面张力。
计算表明,基于国产异构加速卡,对约 2 万原子的体系进行 1ns 模拟,成本低至 1 元。
除了视频教程外,我们提供详细的实操文档,大家可参照这些步骤在超算互联网使用 GROMACS 进行多种体系界面张力的计算研究。
复制下方链接,访问使用教程文档:
https://www.scnet.cn/help/docs/mainsite/hpc/software-examples/practice/gromacs4/
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