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2025-08-13

最佳实践Vol.51 | 基于超算互联网的Gromacs水结冰模拟

        在材料工程领域,水的相变行为(如过冷水结冰)是影响能源储存、材料稳定性及气候模型预测的核心科学问题。

        

        本次实操,我们详细介绍如何基于超算互联网利用分子动力学软件Gromacs进行水结冰模拟全流程:通过TIP4P/ICE水模型构建冰-水两相体系,结合能量最小化、预平衡与长时相变模拟,探究过冷条件下水分子结晶的动力学机制,并结合VMD可视化与Python数据分析,为相变研究、材料设计及气候模型提供可复现的技术实践指南。

        

        超算互联网平台提供预编译的Gromacs软件,支持一键购买和使用。本文测试所用环境与平台提供版本一致,用户可直接通过平台进行计算。


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        Gromacs软件地址:https://www.scnet.cn/ui/mall/search/global?keyword=GROMACS+v2020.6
        
        除了视频教程外,我们提供详细的实操文档,大家可参照这些步骤在超算互联网使用Gromacs进行分子动力学模拟。
        
        原文链接如下,可访问使用教程文档:https://www.scnet.cn/help/docs/mainsite/hpc/software-examples/practice/gromacs3/