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2025-07-18

最佳实践Vol.48 | LAMMPS计算速度自相关函数(VACF)与声子态密度(PDOS)分析详解

速度自相关函数(Velocity Autocorrelation Function, VACF)是表征粒子运动记忆性的关键物理量,它描述了粒子在某一时刻的速度与其在另一时刻速度之间的关联程度。对于固态晶体,VACF主要反映了原子围绕其平衡晶格位置的振动行为。通过对VACF进行傅里叶变换,可以得到声子态密度(Phonon Density of States, PDOS),这对于理解材料的晶格动力学、热容、热导率等性质至关重要。


本期最佳实践,我们详细介绍如何利用分子动力学模拟软件LAMMPS(Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator)计算固态晶体硅在室温(300 K)下的VACF,并提供了使用Python进行数据处理、声子态密度计算和结果可视化的完整代码。通过这一流程,研究人员可以有效地分析晶格动力学行为和相关的热物理性质。


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超算互联网平台提供预编译的LAMMPS软件,支持一键购买和使用。本文测试所用环境与平台提供版本一致,用户可直接通过平台进行计算。
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除了视频教程外,我们提供详细的实操文档,大家可参照这些步骤在超算互联网使用LAMMPS计算速度自相关函数(VACF)与声子态密度(PDOS)。


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https://www.scnet.cn/help/docs/mainsite/hpc/software-examples/practice/lammps3/